Dans cette deuxième aventure, le dresseur Pokemon Sacha Ketchum et ses amis, après une tempête, échouent sur l'île de Shamouti où ils assistent aux cérémonies données par les autochtones en l'honneur des trois oiseaux Pokémon : Sulfura, Electhor, et Artikodin, gardiens du feu, de la foudre et de la glace. Mais le méchant Gelardan en s'emparant du terrible Electhor a brisé l'équilibre cosmique et a déclenché une...